Characterization of North American Armillaria species: genetic relationships determined by ribosomal DNA sequences and AFLP markers

Berlin

2006

S. 145-164

5 Abb., zahlr. Lit. Ang.

Artikel aus einer ZeitschriftUnselbständiges Werk

200132684

Die phylogenetischen und genetischen Beziehungen zwischen zehn nordamerikanischen Armillaria-Arten wurden mit Hilfe von Sequenzdaten der ribosomalen DNA (rDNA), welche die Regionen IGS-1, ITS + 5,8 S und nLSU einschliesst, sowie mit AFLP-Markern analysiert. Die Sequenzdaten ergaben, dass die nLSU-Region bei Armillaria-Arten weniger stark variiert als die ITS + 5,8S sowie die IGS-1 Regionen (nLSU < ITS + 5,8 S <IGS-1). Aus den phylogenetischen Analysen der rDNA-Sequenzen ergab sich eine klare Trennung von A. mellea, A. tabescens und A. nabsnona von den übrigen Arten (A. ostoyae, A. gemina, A. calvescens, A. sinapina, A. gallica, NABS X und A. cepistipes). Verschiedene Arten (A. calvescens, A. sinapina, A. gallica, NABS X und A. cepistipes) bildeten aufgrund ihrer rDNA-Sequenzen eine Gruppe. Am untersuchten Material zeigte sich, dass Techniken, die auf IGS1, ITS + 5,8 S und/oder D-Domain/3'-Enden der nLSU basieren, nicht zuverlässig zwischen A. calvescens, A. sinapina, A. gallica und A. cepistipes unterscheiden können. Im Gegensatz dazu konnten diese Arten mit AFLP-Markern voneinander abgegrenzt werden und die Analyse der AFLP-Daten bestätigte die taxonomische Klassifikation aufgrund konventioneller Methoden (Morphologie und Interfertilitätstests). Die Befunde zeigen, dass AFLP-Marker zur Unterscheidung der derzeit akzeptierten nordamerikanischen biologischen Arten von Armillaria sowie für zukünftige biologische, ökologische und taxonomische Untersuchungen eingesetzt werden können.