Eine schelle Bestimmung von Pseudomonas avellanae-Feldisolaten, dem Erreger einer Haselnußapoplexie in Zentralitalien, durch rep-PCR genomisches Fingerprinting

2000

S. 153-159

16 Lit. Ang.

Unselbständiges Werk

200061861

In Zentralitalien wird die Apoplexie der Haselnuß (Corylus avellane L.), auch als "Moria" bekannt, hauptsächlich durch Pseudomonas avellanae verursacht. Diese Krankheit hat schon mehr als 30 000 Bäume getötet. Die genaue Bestimmung des Erregers ist zur Zeit eine sehr langwierige Sache, bis zu 6 Monate werden für die notwendigen biochemischen, physiologischen und Metabolismusstudien, sowie die pathologischen Untersuchungen gebraucht. Verglichen wurde die Zuverlässigkeit einer repetitiven-PCR (rep-PCR) Technik für die schnelle und genaue Bestimmung des Pathogens mit der traditionellen Methode. Um die Variabilität des Pathogens schätzen zu können, wurden REP, BOX und ERIC Primersets angewandt, um genomische Fingerprints von 60 P. avellanae-Referenzstämmen zu erzeugen. Diese Referenzstämme wurden aus verschiedenen Regionen des Haselnußanbaus gewonnen. Die ERIC-Primer führten zu der besten Unterscheidung zwischen den Isolaten und gruppierten diese nach ihrem geographischen Ursprung. 60 Feldisolate von Haselnußplantagen in Zentralitalien, die mit unterschiedlichen Sorten bepflanzt worden waren, wurden zwischen 1996 und 1998 gewonnen. Diese wurden entweder nach den traditionellen Bestimmungsmethoden oder nach rep-PCR unter Anwendung von ERIC-Primern, bestimmt. Alle nach der traditionellen Methode bestimmten Isolate wurden auch nach der rep-PCR-Methode richtig erkannt. Zellproteinanalyse mit Hilfe von SDS-Page bestätigte diesen Befund. Rep-PCR hat sich als eine zuverlässige Methode für eine schnelle und genaue Bestimmung von Pseudomonas avellanae in Zentralitalien gezeigt und könnte bei der Sanierung dieses Gebietes eine hilfreiche Methode darstellen.