Die molekularen Grundlagen des Lebens ; Erbinformation: Nukleotide und DNA ; Der genetische Code ; Die Proteinbiosynthese ; Chromosomen und Chromatin – Gene, Genome und Genetik ; Endosymbiontengenome in Mitochondrien, Chloroplasten und . . . ? ; Molekulare Besonderheiten ; Die Werkzeugkiste der Gentechnologie ; Leseempfehlungen ; Evolution, Taxonomie, Kladistik und Phylogenetik ; Evolution ; Taxonomie ; Kladistik und Phylogenetik ; Molekulare Phylogenetik ; Leseempfehlungen ; Datenbanken, Alignments, Software ; Die Datenbanken für molekulare Sequenzdaten ; Alignments ; Speziellere Anwendungen in phylogenetischen Analysen ; Graphische Darstellung von Bäumen ; Attraktive Darstellung von Alignments ; Leseempfehlungen ; Stammbäume rekonstruieren: das Allerwichtigste in einem Kapitel ; Phylogenetische Methoden in der Übersicht ; Erste Stammbäume mit MEGA und PAUP* ; Beuteltiere auf die Bäume: MEGA ; Arbeiten mit PAUP* unter Windows ; Die Zusammenfassung: Von den Daten zum Stammbaum ; Leseempfehlungen ; Parsimonieanalyse ; Gar nicht sparsam: Mehr über Parsimonie ; Auf Baumsuche ; Die Messung von Homoplasie ; Oft übergangen: Lücken im Alignment ; Leseempfehlungen ; Distanzverfahren ; Unterschiede zwischen DNA-Sequenzen: Schein und Sein ; Distanzkorrektur: Messen von genetischen Distanzen ; Bäume aus Distanzen I: Suchverfahren ; Bäume aus Distanzen II: Clustering-Methoden ; Geringe Distanz zur Praxis: Distanzen in PAUP* ; Maximum Likelihood ; Berechnung der Wahrscheinlichkeit für einen gegebenen Baum ; ML und Batch Files in PAUP* ; Alternative Suchverfahren und weitere Software ; Bayesianische Statistik ; Frisch ans Werk – die Verwendung von MrBayes ; Bayesianische Statistik – die Hintergründe ; Markov Chain Monte Carlo ; Raten und Zeiten ; Die molekulare Uhr ; Das A und O: Die Kalibrierung ; Phylogramme zu Chronogrammen: r8s ; Relaxed Phylogenetics und BEAST ; Absolute Substitutionsraten und Diversifikationsraten ; Fossile DNA, ancient DNA ; Testen und Vergleichen: Modelle, Bäume und Methoden ; Phylogenetics’ next Topmodel: Welches ist das beste Modell? ; Evaluation von Stammbäumen ; Leseempfehlungen ; Viele Loci, viele Taxa, viele Bäume ; Loci, Taxa und die Probleme ; Mehr als ein Baum: Konsensus und Superbäume ; Nicht immer nur Bäume, auch Netze ; Molekulare Einsichten zu alten und neuen Kladen ; Einsichten und offene (Streit)fragen
