Gene und Stammbäume : ein Handbuch zur molekularen Phylogenetik

München

Springer Spektrum

2006

310 S.

Ill., graph. Darst., zahlr. Lit. Ang.

Monographie

3-8274-1642-6978-3-8274-1642-1

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Gene, Genome und Sequenzen auf der einen Seite, Algorithmen, Computer und Informatik auf der anderen - beide üben Faszination aus, halten aber viele Interessenten auf respektvolle Distanz. Die Schnittstelle der Bereiche ist mit dem modernen Begriff Bioinformatik belegt. In der Tat hat die Synthese von zwei unabhängigen Disziplinen selten so viele faszinierende neue Einsichten geliefert. Eine spannende Teildisziplin der Bioinformatik ist die Molekulare Phylogenetik, deren Ziel die Rekonstruktion von Stammbäumen aus molekularen Daten ist: Computer, moderne Molekularbiologie und Kladistik haben der etwas angestaubten biologischen Systematik und Taxonomie eine ungeahnte Renaissance verschafft. Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - ist nicht unbedingt einfach. Hier will das neue Buch eine Lücke schließen. Die molekularen Datenbanken sind öffentlich und die notwendige Software fast immer kostenlos - man braucht nur PC und das Internet. Einführende Kapitel in die Molekularbiologie, in Evolution, Taxonomie und Kladistik, in Computerprogramme zur Sequenzverwaltung und für molekulare Phylogenetik ermöglichen je nach Wissenshintergrund den schnellen Einstieg. Wer schon etwas weiß, dem wird in einem speziellen Kapitel der direkte Weg zum Stammbaum aufgezeigt. Und wer es genau wissen will, bekommt detaillierte Einführungen in die wichtigen methodischen Ansätze: Parsimonie, Distanzverfahren, Likelihood und natürlich auch die neuen Bayesianischen Verfahren. Alles wird "hands on" anhand von nachvollziehbaren Beispielen mit der gängigen Software besprochen, die aus dem Internet bezogen werden kann (BioEdit, Clustal, MEGA, MrBayes, PAML, PAUP, SplitsTree oder TreePuzzle).